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目录
- 1. 生命的基本特征:
- 2. 细胞是生命的基本单位
- 3. 繁殖(遗传与变异)
- 4. 新陈代谢—物质和能量的交换
- 5. 达尔文与进化论
- 6. 生命科学与我们息息相关
- 7. 生物体的元素组成
- 8. 生物代谢及其调控
- 9. 细胞
1. 生命的基本特征:
- 繁殖 (reproduction)
- 新陈代谢 (metabolism)
- 应激 (response to the environment)
- 进化与适应 (evolution and adaptation)
2. 细胞是生命的基本单位
3. 繁殖(遗传与变异)
- 有性繁殖: 由雌雄两性生殖细胞结合成受精卵而发育成新个体的生殖方式
- 无性繁殖: 只牵涉一个个体,亲体不通过两性细胞的结合而产生后代个体的生殖方式。如营养生殖、出芽生殖、(无性)孢子生殖等
- 遗传: 生物通过繁殖产生与自身相似的后代,这种现象叫遗传
- 变异: 子代与亲代之间及子代不同个体之间产生的一定程度的差异,即变异
4. 新陈代谢—物质和能量的交换
- 物质的同化作用(合成代谢)或异化作用(分解代谢)
- 能量的捕获与释放
5. 达尔文与进化论
1859 年 11 月 24 日,《物种起源》出版, 奠定了进化论的理论基础。主要观点:
- 共同祖先:所有的生物都来自共同的祖先, 生物从简单到复杂演化。(挑战神创论)
- 自然选择:物竞天择,适者生存
5.1. 进化与适应
优胜劣汰,适者生存
5.2. 癌症:进化的遗产
从达尔文进化论的角度来认识 癌症的发生与发展
- 肿瘤高度异质,多个竞争性亚克隆通过微环境中的自然选择获得生存与发展(转移)
- 癌细胞的返祖(单细胞生物)现象?
5.3. 自私的基因 by【英】理查德·道金斯
- 生物体都是基因所创造的机器
- 成功基因都具有无情的自私性
- 自私基因的目的是最大限度壮大其基因库队伍
- 基因的自私性导致个体行为的自私性,但在利于 延续其个体基因的前提下,滋生有限的利他主义 (虎毒不食子)
6. 生命科学与我们息息相关
6.1. 生物界有序的多结构层次
涌现:生命世界中每出现一个较高层次的结构都会产生一些新的特征, 这些特征产生于低一个层次组成元素之间的互作。 它由部分组成,又不等于部分相加 ( 1+1≠2 )
6.2. 从认识论上把握生物学
- 生物与环境-—生存之道
- 结构与功能-—阐明机制
- 微观与宏观-—内外相通
- 进化与保守-—进退适宜
6.3. 生物统一性
- 具有共同的遗传物质,使用同一套遗传蜜码
- 具有相似的转录机制,从 DNA 拷贝 RNA
- 具有类似的翻译系统解读遗传信息
- 具有几乎完全相同的基础代谢路线
- 细胞的组成结构极其相似
- 处在同一进化阶梯的生物具有相同的解剖学结构,起源于 同一祖先
- 不同的生物处在同一生命之树的不同分枝,有共同的远祖。
当我们在同一水平比较不同生物的差异时就会发现:随着人们的视野从宏观水平向微观水平推进,不同生物之间的差异变得越来越少,相似性则越来越多
6.4. 生命科学研究的发展阶段
- 描述生物学阶段(19 世纪中叶以前): 侧重个体生物学和细胞生物学,主要研究形态结构、生理特征、分类、生态分布及遗传进化。大多是描述性结果。对种群的特点和生理功能的解释起一定作用。
- 实验生物学阶段(19 世纪中到 20 世纪中): 利用各种仪器工具,通过实验过程,探索生命活动的内在规律。
- 综合生物学现代生物学阶段(20 世纪中叶以后):分子水平入手,不同分支学科和跨学科交叉,对整个生命系统从个体到体系,从体内到体外进行统一的整合和解释,注重机制研究。
6.4.1. 学科交叉对生命科学研究的意义
取百家之长,成一家之言
- 达尔文受地质学家赖尔关于地质变动思想的影响及马尔萨斯人口论的启发创立了进化论。
- 孟德尔将统计分析引入遗传研究,开创了经典遗传学时代,奠定了现代遗传学基础。
- 量子物理学家薛定鄂将信息学引入生物学,提出密码子概念,引发了生命科学研究的革新, 是分子生物学的前奏。
- 结晶学与生物大分子结合建立了结构生物学。
- 计算机技术、数学、分子生物学等结合创立了生物信息学
7. 生物体的元素组成
- 地壳中的主要元素: 氧硅铝铁钙钠钾镁
- 生物体的元素组成
7.1. 生物体 25 种必需元素
- 基本元素(4):氧(O)、碳(C)、氢(H)、氮(N),占 96%以上, 是核酸、蛋白质、糖和脂肪的主要成分
- 常量元素(7):钙(Ca)、磷(P)、钾(K)、硫(S)、钠(Na)、 氯(Cl)、镁(Mg),占 3.7%
- 微量元素(11):硼(B)、钴(Co)、镍(Ni)、铜(Cu)、氟(F)、 碘(I)、铁(Fe)、锰(Mn)、钼(Mo)、硒(Se)、 锡(Sn)、硅(Si)、矾(V)、锌(Zn),含量<0.01%
生命在海洋中产生,动物血液就其元素组成来说与海水的盐类组成很接近;现在人类血液的组成不仅与海水成分相似,而且各元素的丰度分布趋势也有很多的类似性;然而,即使是海洋里的植物,其体液的成分也与海水相去甚远。
7.2. 生命元素与人体健康
- 钙的生理功能:
- 大部分钙以羟基磷酸钙晶体形式存在于 骨骼和牙齿中,是人体的支架;
- 少量钙存在于体液与软组织中,有助
- 血液的凝固
- 神经的兴奋
- 肌肉的收缩
- 钙缺乏的临床表现:
- 婴儿的佝偻病
- 成人骨质软化症
- 老年骨质疏松症
- 钙的食物来源:
- 奶及其制品
- 豆类及其制品
- 海产品
- 木耳、野菜及某些蔬菜
- 铁的生理功能:
- 参与氧的运输与组织呼吸过程(血红蛋白、肌红蛋白、细胞色素及呼吸酶的组成部分)
- 维持正常的造血功能
- 调节免疫功能
- 促进脑发育及改善脑功能
- 铁缺乏的临床表现: 缺铁性贫血, 主妇综合征, 异食癖
- 铁的食物来源:动物肝脏及动物全血畜禽肉类、鱼类及鸡蛋(蛋黄)木耳、香菇、芝麻等,但吸收不好
| 元素名称 | 缺乏后的症状 | 补充的食物来源 |
|---|---|---|
| 钙 | 婴幼儿的佝偻病、成年人的骨质疏松症、腰酸背痛。 | 奶类、豆制品、海产品 |
| 铁 | 缺铁性贫血 | 动物肝脏、动物全血、肉 类、蛋类 |
| 碘 | 甲状腺肿大(大脖子病)、 儿童智力低下 | 海带、紫菜及海产品 |
| 锌 | 食欲不振、生长迟缓 | 海产品、肉类 |
| 氟 | 龋齿、骨质疏松 | 鳕鱼、鲑鱼、沙丁鱼等 |
| 硒 | 克山病、大骨节病 | 芝麻、蘑菇、大蒜 |
7.3. 生命中的化学键
- 离子键: 因高电负性将另一原子的价电子捕获而组成完全的电子层(静电作用),涉及电子从一个原子转移到另一个原子。失去电子的原子为阳离子, 获取电子的原子为阴离子
- 共价键: 两个原子之间共享成对的价电子
- 非极性共价键: 原子间等同地共享的 共价键如 H2,O2
- 极性共价键: 原子间非等同地共享的 共价键如 H2O
生命中的弱化学键
- 氢键:极性分子中带电区域与相邻分子带相反电荷的区域相互吸引,是较弱的静电吸引力
- 范德华力:两个原子之间相距足够近时产生的弱的、非特异性相互作用力。比化学键弱得多,且在极性分子与非极性分子间都可形成。
- 疏水作用:非极性分子间的一种弱的非共价的相互作用,这些非极性的分子在水相环境中具有避开水而相互聚集的倾向.
生物分子的弱相互作用在大分子的构型、 生物大分子的互作、分子在细胞中的定位 、生理生化反应中均起到重要作用。
7.4. 生命之源—水
- 生命诞生于水中,进化 30 亿年后才上岸
- 水是一切生理生化反应必需的介质、底物或者产物
- 水维持细胞的形态结构和膨压,调节渗透压
- 体内物质的运输离不开水,植物通过水的蒸 发将营养物质输送到地上部组织
- 细胞含水量 70-95%,生物体中水占 70%以 上
- 水具有高比热和高蒸发热,能够稳定大气温度,海洋温度,并使地球有丰富的液态水,使生物避免过热,是调节体温重要介质。
- 水分子是偶极子
- 水分子中电荷分布不对称,一侧显正电性, 另一侧显负电性,从而表现出电极性, 是典型的偶极子(dipole)
- 水分子之间可建立弱作用力氢键, 水中每一氧原子可与另两个水分子的氢 原子形成两个氢键。每个分子最多可与 4 个相邻分子形成氢键
- 水分子的上述特性,使其既可同蛋白质中的正电荷结合,也可同负电荷 结合。蛋白质中每个氨基酸平均可结合 2.6 个水分子,极性蛋白质溶于水
- 水分子的内聚力和粘着力: 树的极限高度与水的运输有关
- 水的 pH 值与缓冲液: 含 CO2 的水是很好的缓冲液
- 常温(250C)下纯水每 10-7 个分子中只 有一个水分子解离为 H+和 OH-
- 水是生命物质的溶剂,活细胞内 pH ~7, [H+] 和 [OH-]影响细胞分子的结构和功能.
- 大多数生物的体液 pH 值在 pH 6—pH 8 之间,人体血液的 pH 值接近 7.4, 如果血液 pH 降至 7 以下或高于 7.8, 则只能存活几分钟
- 生物可利用缓冲液调节体内 pH 值的 变化,以保证生化反应的正常进行
- 人体血液和其它生物体液的缓冲液 之一为碳酸 (H2CO3),H2CO3 = HCO3- + H+
- 酸雨对生物会造成毁灭性灾害
7.5. 碳与有机分子
- 碳原子的特性
- 碳原子为四价元素,可与其它原子在最多四个方向形成 4 个强的共价键
- 碳原子彼此间以单键、双键或三键结合形成链状、分支链状或环状结构,称为有机化合物的碳骨架→是生命分子多样性的基础
- 所有生物大分子的骨架均由碳原子组成
- 碳原子之间形成的共价键有很高的键能,是光能转变为化学能的主要储存方式
- 碳骨架分子多样性: 碳骨架分子的性质取决于
- 碳骨架的长度
- 碳骨架的排列
- 共价键的形式及位置
- 是否环化
- 碳骨架分子异构体
- 结构同分异构体:相同的原子组成 共价键,但共价键的相对位置不同
- 几何同分异构体:相同的原子组成共价键,但共价键连接的原子排列不同
- 对映结构体:互成镜像的分子
- 碳骨架连接的功能基团:羟基、羰基、羧基、氨基、巯基、磷酸酯、甲基
- 生物有机大分子(糖类、脂类、蛋白质、核酸)
- 糖类:生命过程的碳源和能源
- 脂类:生命体的重要构件和储能物质
- 核酸:遗传信息的储存和传递者
- 蛋白质:遗传信息的表达者
- 单体有机分子聚合成为生命大分子
- 糖:多羟基醛或多羟基酮及其缩合物或某些衍生物, 由 C、H、O 三种元素形成,而且
H:O 比为 2:1,故又称“碳水化合物”
- 单糖(不能再水解的糖类):丙糖(甘油醛)、戊糖(核糖/脱氧核糖) 己糖(葡萄糖
/果糖/半乳糖). 葡萄糖是生物体内最丰富和最重要的单糖
- 醛糖:第一位碳原子上连接醛基,-CHO,单糖,如葡萄糖
- 酮糖:第二或第三碳原子上连接酮基,-C=O,单糖,如果糖
- 二糖:麦芽糖、蔗糖、乳糖. 蔗糖=葡萄+果;麦芽=2 葡萄;乳糖=半乳+葡萄
- 寡糖:由多个相同单糖分子连接的多聚分子,又称低聚糖
- 多糖:均一多糖:淀粉、纤维素、糖原、几丁质;
- 淀粉(直链、支链):马铃薯和谷物是膳食中淀粉的主要来源
- 糖原:大部分储存在肝和肌肉细胞中
- 纤维素:植物细胞壁的主要成分
- 几丁质(chitin): 2-乙酰基葡萄糖直链多聚体,又名甲壳素、甲壳质、 壳蛋白、明角质,化学结构与天然纤维素相似。它们是昆虫、蟹、虾 外壳的主要成分。在虾 蟹壳中,碳酸钙约占 45%,粗蛋白和脂肪占 27%,几丁质约 20%左右。许多真菌的细 胞壁也由几丁质构成。 在外科手术中几丁质可用来缝合伤口, 伤口愈合后可自行分解。
- 非均一多糖:透明质酸、软骨素
- 糖类分子的生物学功能
- 生命活动的主要能源
- 光能转变为化学能的储存方式主要是形成葡萄糖
- 糖类分子可为生物的各种生理生化反应提供能源
- 代谢过程中的重要中间代谢物
- 形成核酸、蛋白质、脂肪、维生素等的原料
- 细胞重要的结构成分
- 某些多糖,如纤维素,是植物的主要结构成分
- 某些糖类如几丁质,组成动物的外壳保护成分
- 单糖(不能再水解的糖类):丙糖(甘油醛)、戊糖(核糖/脱氧核糖) 己糖(葡萄糖
/果糖/半乳糖). 葡萄糖是生物体内最丰富和最重要的单糖
- 脂类: 脂类是指生物体内不溶于水而溶于有机溶剂的各种小分子, 主要由碳、氢、氧元素构成。
- 甘油三酯:脂肪(动物)和油(植物). 甘油的 3 个羟基与脂肪酸的羧基缩合形成酯键,这类分子称为甘油三酯。 动物含饱和脂肪酸较多,常温下可凝固称为脂肪。植物含不饱和脂肪酸较多,常温下呈液态,称为油。
- 磷脂:一个甘油分子和两个脂肪酸分子。如卵磷脂、脑磷脂等
- 萜类:叶绿醇-叶绿素,ß-胡罗卜素,维生素 A,薄荷醇,樟脑 萜类是自然界中,分子式为异戊二烯单位的倍数的烃类及其含氧衍生物。这些含氧衍生物可以是醇、醛、酮、羧酸、酯等。萜类是某些植物的香精、树脂、色素等的主要成分。如玫瑰油、桉叶油、松脂等。另外,某些动物的激素、维生素等也属于萜类化合物。 维生素 A, D, K, E 是脂溶性维生素, 属于异戊二烯类化合物, 调节生物体的代谢作用和一些重要的生理生化功能。
- 固醇(或甾醇):胆固醇-心血管疾病、膜的成分,性激素
- 蜡:高级脂肪酸与高级脂肪醇组成的脂。可防水分丧失,抵御干燥环境的胁迫
- 脂类分子的生物学功能
- 细胞膜的组成成分:磷脂,胆固醇
- 高能量的储存分子:膳食中的脂肪
- 某些激素分子的前体:萜类(生长激素、保幼激素)、甾醇(性激素)
- 保护性的结构成分:生物腊(水果及叶片表面;动物体表,羽毛及昆虫表皮)
- 蛋白质: 细胞最重要的结构成分,占细胞干重 50%以上, 结构和功能最多样的大分子(人体内高达数万种),参与所有的生命活动. 基本组成单位是氨基酸.
- 蛋白质的氨基酸组成: 自然界有 180 多种氨基酸,参与蛋白质合成的仅 20 种。
- 8 种必需氨基酸:缬氨酸、亮氨酸、异亮 氨酸、苏氨酸、蛋氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、赖氨酸 (+组氨酸,儿童)
- 酸性氨基酸:中性溶液中分子带负电
- 碱性氨基酸:中性溶液中分子带正电
- 不带电的极性氨基酸
- 非极性氨基酸
- 肽键: 一个氨基酸的-COOH 与另一个氨基酸的-NH2 脱水形成肽键。 2个氨基酸组成二肽,n 个氨基酸组成 n 肽
- 肽链有方向性:氨基端(N端)-— 羧基端(C端)
- 蛋白质一级结构:肽链
- 蛋白质的 3 种二级结构:α-螺旋、β-折叠和转角。
- 蛋白质三级结构和四级结构
- 维持蛋白质高级结构的作用力:二硫键、离子键、氢键、静电作用、疏水作用、范德华力。
- 蛋白质的氨基酸组成: 自然界有 180 多种氨基酸,参与蛋白质合成的仅 20 种。
- 核酸: 细胞内遗传信息的携带者, 在生物体的遗传、变异和蛋白质的生物合成中扮演极其重要的角色
- 核酸的种类:DNA,RNA
- DNA 的结构特点
- DNA 由两条具有极性的互补单链组成, 两条互补单链走向相反
- 两条单链彼此互旋形成螺旋结构,每旋转一圈为 10.5 bp (碱基对),天然 DNA 大多数为右旋,双螺旋中大小沟交替排列
- 碱基配对原则:A-T,C-G,A-T 配对形成 2 对氢键,C- G 配对形成 3 对氢键
- 配对碱基位于双螺旋 DNA 的内部, 碱基 平面与 DNA 双螺旋的纵轴垂直,产生碱基堆积力
- 脱氧核糖与磷酸连接排列在外侧构成基本骨架
- RNA 的结构特点
- 生物体内几乎所有的 RNA 分子均为单链
- RNA 分子中对应于 DNA 中胸腺嘧啶(T)的碱基由尿嘧啶(U)取代
- 配对原则与 DAN 碱基配对类似, 只是 DNA 中的 A-T 配对在 RNA 中为 A-U 配对
- RNA 分子内配对可形成茎环(或发夹)结构
- RNA 分子易断裂, 长度有限
- 生物体内几乎没有任何双链环化 RNA 分子
- RNA 分子种类
- 编码 RNA:mRNA 是基因转录的产物, 含有三联密码子氨基酸编码顺序
- 非编码 RNA: tRNA,rRNA,microRNA,snRNA, siRNA,…… tRNA 为三叶草结构, 有三个臂, 分别为 D-环, T-环和反密码子环 由头尾互补碱基组成的结构为氨基酸结合位置, 其 3'端有-CCA-单链突出;
- rRNA—核糖体 RNA。这是与核糖体大亚基蛋白质结合的 rRNA,有 6 个结构域
- 糖:多羟基醛或多羟基酮及其缩合物或某些衍生物, 由 C、H、O 三种元素形成,而且
H:O 比为 2:1,故又称“碳水化合物”
- 中心法则
- 遗传信息从 DNA 传递给 RNA,再从 RNA 传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程
- DNA 的自我复制
- 某些病毒 RNA 的自我复制(烟草花叶病毒)
- 某些病毒以 RNA 为模板逆转录成 DNA(某些致癌病毒)
7.6. 耗散理论: 生物体-–—典型的耗散结构
自组织理论:耗散结构(dissipative structure);协同学(Syneraetics) (H.Haken)
“当系统处于远离热力学平衡的状态时,在一定外界条件下,由于系统内部非线性相互作用,可以经过突变而形成新的有序结构-–—耗散结构。”
这里的耗散指的是系统维持这种新型结构需要从外界输入能量或物质。
- 耗散结构的主要特征:
- 远离热力学平衡态;
- 开放系统,与环境有物质和能量交流;
- 组元众多,且存在非线性相互作用;
- 涨落是有序结构形成的触发器。
- 生命的主要特征:
- 高度有序的结构;
- 新陈代谢;
- 核酸、蛋白质、糖、脂肪等众多组分,复杂相互作用;
- 总是处于动态平衡中
生物体不断地纳入负熵,输出正熵,以保持热力学平衡
7.7. 能量货币—ATP
自由能变化决定化学反应方向, 利用偶联推动能量不利反应的进行
细胞中很多反应是能量不适宜的 (ΔG>0). 细胞通过将该反应与一个ΔG 负值很大的反应偶联,使得两个反应的ΔG 总和为负值,从而推动反应的发生. 细胞中能量不适宜的反应常常与 ATP 水解偶联
ATP 的循环再生
- ATP + H2O → ADP + Pi ΔG = -30.5 kJ/mol
- ADP + Pi → ATP + H2O ΔG = +30.5 kJ/mol
ATP 循环把能量从分解代谢传递到合成代谢
细胞中的耗能活动—消耗 ATP
p 代谢的核心—酶
7.8. 酶的结构与分类
- 酶(enzyme):一类由活细胞产生、对其底物具有高度特异性和高度催化效能的蛋白质。只具催化作用,自身并不转变成其它分子,也不改变自身的结构与活性。
- 单纯酶:仅含有蛋白质组分
- 结合酶:蛋白质+辅助因子
- 辅助因子 (与蛋白结合紧密程度):
- 辅基:结合紧密,不能用透析或超滤方法除去. eg:有机物或金属离子
- 辅酶:结合松弛,可用透析或超滤方法除去. eg:维生素及其衍生物
- 核酶(ribozyme):一类具有催化活性的 RNA 分子
- 酶的作用特点
- 催化效率很高—比一般的化学催化剂的效率高 107~1018 倍
- 酶催化的专一性
- 反应专一性:一种酶只能催化一种反应或一类相关反应
- 底物专一性:一种酶只对一种底物起作用
- 作用条件是温和的: 常温、常压、中性 pH
- 酶的作用是受调控的: 酶浓度的调节,激素调节,酶原的激活等
- 酶的催化机制:降低活化能
- 活化能:用于克服能障,使化学键断裂,促使化学反应进行所需的能量
能障:启动某一化学反应时存在的能量障碍
酶促反应(酶催化)的核心:降低化学反应所需的活化能,并能在温和的常温常压条件下促使反应进行
酶催化反应的高效率原因:特异性结合并稳定化学反应的过渡态以降低反应能级
- 提高酶促反应方法
- 提高底物在反应区间的浓度
- 使反应基团正确定位以便反应底物之间直接接触
- 通过改变反应底物的分子几何构型和电子轨道的分布降低活化能
- 提高酶促反应方法
酶的催化专一性:诱导契合假说
- 调控酶活性的因素: 温度:不同酶的最适催化温度不同: pH 值:不同酶的最适催化 pH 值不同; 底物浓度; 抑制剂:竞争性抑制剂、非竞争性抑制剂
- 反馈抑制
- 辅助因子
8. 生物代谢及其调控
8.1. 新陈代谢
新陈代谢(Metabolism):生物体内进行的全部物质和能量变化的总称
- 物质代谢(Substance metabolism):各种食物在体内的消化吸收,运转和排泄等与生理有关的化学过程以及生物体内的全部同化作用和异化作用
- 同化作用(Assimination):小分子合成大分子的过程
- 异化作用(Dissimilation):复杂化合物分解为简单小分子
- 能量代谢(Energy metabolism):生物体内机械能、化学能、热能和电能等各种能量的产生,转化和利用
8.1.1. 新陈代谢的特点
- 区域性:亚细胞水平、细胞水平、组织水平
- 有序性
- 可控性: 能量的释放和消耗是逐步发生的,受到精确调控:
- 代谢调节: 正反馈、负反馈
- 信号调节: 激素、神经递质、环境压力
- 发育调控: 营养生长、生殖、衰老
8.1.1.1. 酶促反应
8.1.1.2. 动态平衡
8.1.1.3. 代谢路线交叉
8.2. 细胞呼吸
细胞呼吸:细胞中的线粒体利用食物中的有机大分子(主要是葡萄糖),经过氧化反应产生 ATP,为生命活动提供能量的过程。
- 生物氧化过程
- 阶段 1:大分子降解成单体分子
- 阶段 2:单体分子降解生成乙酰辅酶 A, 同时产生少量 ATP 和 NADH
- 阶段 3:乙酰辅酶 A 进入三羧酸循环 完全氧化成 CO2 和 H2O,同时产生大量 NADH 和 FADH2
- 阶段 4:携带高能电子的 NADH 和 FADH2 通过电子传递链进行 氧化磷酸化产生大量 ATP
- 葡萄糖的生物氧化过程
- 糖酵解-–—C6→C3: 在胞质中进行,不消耗氧气; 一分子葡萄糖产生两分子磷酸甘油醛,C6=2C3; 消耗 2 个 ATP.
- 糖酵解-–—生成丙酮酸 底物水平磷酸化:通过酶把底物分子上的磷酸基团转移到
ADP 形成 ATP 和新的有机分子的途径。在胞质中进行,不消耗氧气; 两分子磷酸甘油醛生成两分子丙酮酸,2C3=2C3: 通过底物水平磷酸化产生 4 个 ATP: 氧化还原反应生成 2 个 NADH.
- 糖酵解产生的能量:通过糖酵解 1 分子葡萄糖最终生成 2 分子丙酮酸 +2ATP +2NADH; 糖酵解仅释放出葡萄糖化学能的 3.5%; 无氧条件下 NADH 不能进入电子传递链,所含能量不可利用。
丙酮酸脱羧形成乙酰辅酶 A
- 两分子丙酮酸通过转运蛋白协同扩散进入线粒体
- 氧化还原反应生成 2 个 NADH
丙酮酸脱氢酶系:一种催化丙酮酸脱羧反应的多酶复合体,在其催化下,丙酮酸转化为乙酰 CoA 和 CO2。
- 三羧酸循环: 因其代谢途径中有几个中间代谢物具有三个羧基,故称三羧酸循环;又因其循环由柠檬酸开始,故也称柠檬酸循环。
- 反应在线粒体基质中进行
- 底物为乙酰辅酶 A
- 每循环一次,2次脱羧,产 生 2 个 CO2
- 底物磷酸化产生 1 分子 ATP
- 氧化还原反应产生 3 分子 NADH+H+,1分子 FADH2
氧化磷酸化
- 来自 NADH 的 2 个高能电子在通过电子传递 链复合物 I, III 和 IV 时,将膜内侧的质子泵出膜外,这些质子在返回膜内时可合成约 3 个 ATP
- 来自 FADH2 的一对电子只在经过复合物 III 和 IV 时下降的能量才足以将质子泵出膜外,因而最终只产生约 2 个 ATP
电子传递产生质子跨膜运输: 电子传递的最终结果是氢质子的跨膜传递,产生跨膜质子梯度。
- 化学渗透偶联: 阶段 1:电子传递驱动质子泵泵出质子;阶段 2:质子梯度驱动 ATP 的合成. 线粒体、叶绿体和原核生物都是利用化学渗透耦联途径来产生生命所需的能量的
一分子葡萄糖氧化分解可产生多少 ATP? 实际上由于: 线粒体内膜有泄漏; 线粒体膜常常利用质子势能梯度能量转运有机物如丙酮酸,而不经过 ATP 酶产生 ATP。
1 分子葡萄糖在真核细胞中经过充分氧化磷酸化约产生 30 个 ATP。
10 NADH X 2.5 ATP + 2 FADH2x 1.5 ATP + 2ATP = 30 ATP
- 细胞呼吸的效率: 1mol 葡萄糖产生的 ATP 相当于 1150kJ,而 1mol 葡萄糖燃烧产生的能量约 2870kJ,即细胞通过呼吸氧化利用葡萄糖的效率约 40%
- 有氧呼吸:指细胞在有氧的参与下,通过各种酶的催化作用,把葡萄糖等有机物彻底分解产生二氧化碳和水,同时释放能量产生 ATP 的过程。
- 无氧呼吸(无氧酵解):细胞在无氧条件下,通过酶的催化作用, 把葡萄糖等有机物分解为不彻底的氧化产物(乙醇或乳酸),同时释放出少量能量的过程。
- 乙醇发酵:丙酮酸分两步生成乙醇:
- 丙酮酸氧化释放一个 CO2,并产生一个乙醛;
- 乙醛由 NADH 还原生成乙醇,并再生 NAD+用于进一步酵解。
- 乳酸发酵:丙酮酸直接由 NADH 还原生成乳酸,不释放 CO2
- 乙醇发酵:丙酮酸分两步生成乙醇:
- 糖的合成与降解
- 糖异生:非糖化合物(如丙酮酸,乳酸、甘油、生糖氨基酸、TCA 循环的中间物等)在肝脏中酶的作用下转变为葡萄糖或糖原的过程。
- 三羧酸循环—中心代谢途径
- 分解代谢:三羧酸循环实际是糖、脂、蛋白质等有机物在生物体内末端氧化的共同途径。
- 合成代谢:为物质的生物合成提供前体分子 。如草酰乙酸是合成天冬氨酸的前体,α-酮戊二酸是合成谷氨酸的前体。
8.3. 光合作用
光合作用:绿色植物通过叶绿体,利用可见光中的光能,把二氧化碳和水合成为储存能量的糖类(通常指葡萄糖),并且释放出氧气的过程。
8.3.1. 光合作用的几个要素
- 太阳能 (提供能量,光子)
- 二氧化碳 (提供碳素)
- 水 (提供电子)
- 叶绿体 (光合作用场所)
8.3.2. 光能传递和线性非循环电子传递链
光反应在类囊体膜上进行,在叶绿素参与下,将光能转变为化学能。叶绿素吸收太阳光能,水分子被光解,产生 O2 、H+ 和 e- ,后者的传递过程中生成两种高能化合物 ATP 和 NADPH 。
- 光系统 I(PSI):含 P700 的高度特化的叶绿素 a(光吸收高峰在 700nm)
- 光系统 II(PSII):含 P680 的高度特化叶绿素 a(光吸收高峰在 680nm)
电子传递链连接 PSI 和 PSII
8.3.3. 水光解
- 光合系统 II 吸收光能,反应中心叶绿素 P680 中的电子被激发进入很高的能阶,并被初始电子受体捕获。被氧化的叶绿素成为极强的氧化剂
- 光合系统 II 中的酶可从水分子中获取电子用于还原叶绿素,这一过程将水分子裂解(水裂酶)成两个质子和一个氧原子。裂解的 氧原子立即与另一个氧原子结合形成 O2,这是一个放氧过程。解 离的质子释放到类囊体腔内
8.3.4. 光合磷酸化
电子在电子传递链中传送时, 将类囊体外质子泵入膜内,另外水光解产生的质子也释放入类囊体内腔内,从而形成质子电化学梯度。 质子在通过 ATP 合成酶从类囊体内腔进入膜间区时催化 ADP 和 Pi 合成 ATP。
8.3.5. 循环电子传递链
碳反应所需 NADPH 和 ATP 的量可调节循环和非循环光合磷酸化的比例
8.3.6. 卡尔文循环—碳反应
碳反应:: 利用 ATP 和 NADPH 中的能量固定 CO2 生 成糖类化合物(葡萄糖),反应在基质中进行。
- 固定一分子 CO2 需要 3 个 ATP ,2个 NADPH
- 产生一分子葡萄糖(6次 CO2 固定)消耗 18 个 ATP,12 个 NADPH
8.3.7. RUBP(二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶)
核酮糖二磷酸羧化酶(RUBP or Rubisco )每秒钟只能固定 3 个 CO2 分子;
植物叶片中一半蛋白是 Rubisco , Rubisco 是地球上最丰富的蛋白质, 每人可以分到 10kg!
Rubisco 是一个双功能酶,既可结合 CO2 执行同化作用(固定 CO2), 又可结合 O2 执行异化作用(氧化分解二磷酸核酮糖), 活性取决于细胞内 CO2/O2 之比。
由于 Rubisco 的氧化功能可以消耗光合作用产物,大大降低了光合作用的效率。这一特性被称为光呼吸,光呼吸浪费的光合作用产物可达 3040%。
8.3.8. 光呼吸—影响光合作用效率的主要因素
光呼吸系指在二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(Rubisco)的氧化酶活性作用下将 1,5-二磷酸核酮糖分解为 3-磷酸甘油酸和 2-磷酸乙醇酸,随后 2-磷酸乙醇酸又进入氧化分解产生 CO2 的过程。
8.3.9. C3 植物与 C4 植物
- C3 植物的叶肉细胞中含有叶绿体,进行固碳作用。
- C4 植物中,叶肉细胞 专门用于吸收 CO2 而不是用于固碳。因而在维管束细胞中 CO2 /O2 比率很高,是固碳循环的场所。
玉米这类 C4 植物可以主动“捕获”二氧化碳,而其他 C3 植物更像是“守株待兔”。 玉米更加耐受高温、高光强和低二氧化碳浓度。这三大优势让玉米在应对未来可能遭遇的末日环境中占据了先机。
8.3.10. 光合作用的意义
- 为一切生物生命活动的进行提供所必需的营养物质(食物链最低端)
- 为一切生物生命活动的进行提供所必需的能量
- 维持大气中氧气和二氧化碳的平衡
总之,从物质转变和能量转变的过程来看,光合作用是生物界最基本的物质代谢和能量代谢。
9. 细胞
9.1. 细胞膜
9.1.1. 细胞膜需要具备哪些功能
区域隔离; 跨膜物质运输; 信号传导; 细胞之间的相互作用
9.1.2. 水分子的跨膜扩散
- 质膜对于水是半透性的,水分子可以通过渗透作用从溶质浓度低的区域向溶质浓度高的区域穿过半透膜;
- 动物细胞中通常保持等渗;
- 植物细胞通过高渗保持对细胞壁的膨压;
- 有些细胞中含有水孔蛋白,是水分子高度特异的亲水通道。
9.1.3. 膜运输蛋白的分类
- 载体蛋白:与待转运的溶质结合,通过一系列构象变化, 跨膜转运结合的溶质。
- 通道蛋白:与待转运溶质的相互作用弱的多,它们形成 横跨脂双层,充满水的小孔。当小孔打开时,允许特殊 溶质(通常是具有适当大小和电荷的无机离子)通过。
9.1.4. 离子通道的高度选择性
离子通道的孔径都很小,只有大小合适的、带特定电荷的离子才能通过,这个特征叫做选择性通透,例如钾通道对钾离子的通透速率是钠离子的一万倍。
9.1.5. 什么决定了物质运输的方向?
在生物膜两侧大部分分子和离子的分布是不均匀的,常常有跨膜的浓度差异。对于带电荷的离子或者分子,由于膜电位的存在,膜两侧还存在着电势能梯度。
浓度梯度和电势能梯度共同构成了电化学梯度(electrochemical gradient),它们是驱动分子和离子跨膜运输的一种能量。
9.1.6. 被动运输与主动运输
- 分子或离子顺电化学梯度跨膜运输,不需要消耗另外的能量,就叫做被动运输,包括简单扩散和易化扩散。如果这个顺电化学梯度的运输需要膜蛋白的帮助,但不额外消耗能量,也称作易化扩散。
- 如果需要提供额外的能量、逆着电化学梯度跨膜运输,这个过程就叫做主动运输。主动运输是由一些称作泵的转运蛋白完成的,它们有很强的方向性。
9.1.7. 主动运输的方式
主动运输的转运蛋白对代谢小分子的跨膜运输起着关键的作用,在一些特殊的哺乳动物细胞中,三分之二的代谢能量被消耗 在跨膜运输的过程中。根据能量的来源不同在细胞中有三种主动 运输的方式: ATP 驱动泵、协同转运和光驱动泵。
9.1.7.1. 钠钾泵-–—ATP 驱动泵
一个典型动物细胞 1/3 的能量被这种钠钾泵给消耗了。生理意义何在?
p 维持 pH,膜电位和渗透压 p 利用制造的钠离子梯度运输营养物质
9.1.7.2. 协同转运的类型
单向转运 同向转运 反向转运
9.1.7.3. 光驱动泵
9.1.8. 胞吞胞吐
蛋白质等大分子出入细胞
9.1.9. 细胞膜的脂筏模型
- 膜上一些特殊的脂质能形成稍厚的微区,这种大小约 70 纳米的动态结构像筏子一样,带着大量的膜蛋白以集中完成各种复杂功能,这就是生物膜的脂筏模型。
- 脂筏模型是对流动镶嵌模型的补充。
9.1.9.1. 膜流动性的意义何在
- 膜的流动性对细胞膜执行物质转运、信号转导等重 要生物学功能至关重要
- 膜的流动性降低甚至凝固(如在低温条件下),将限制蛋白质和酶的功能
- 一些耐寒植物的细胞膜含有较高比例的不饱和脂肪酸,可在低温下保持流动性,从而确保细胞膜正常 的生物学功能
9.1.9.2. 如何调节膜的流动性以适应环境
- 膜脂肪酸链对流动性的影响主要是不饱和程度和链的长短:如果脂质中碳氢链较短或者含有双键,相变温度就会降低,这样膜在较低的温度下还可以保持流动性。
- 胆固醇使得脂质在双层中堆积更为紧密,在大部分动物细胞膜中高浓度的胆固醇,还可以防止碳氢链聚合以及结晶态的形成。相变温度以上限制流动性,相变温度以下增加流动性。
9.1.9.3. 膜不对称性有什么意义
- 不对称导致膜两侧电荷数量、流动性和方向性等的差异,这保证了膜内外物质交流与信息传递等重要生物反应的正确方向性。
- 动物还可以利用质膜磷脂的不对称性来区分活的和死的细胞。
9.1.10. 细胞膜的主要特性
流动性和不对称性
9.2. 从原核细胞到真核细胞发生了哪些变化
原核细胞和真核细胞均具有的细胞器是什么?→ 核糖体和蛋白酶体
用一个字概括原核细胞与真核细胞的差异?
9.3. 能量细胞器:叶绿体与线粒体
高效地把能量转换成细胞可利用形式的细胞器
- 线粒体和叶绿体含有自身的遗传物质–DNA
- 线粒体和叶绿体可以相对独立地复制自身的 DNA, 有相对独立的基因转录系统和翻译系统。含有内部的核糖体,可以合成自身编码的蛋白质
- 线粒体和叶绿体的复制、转录和翻译系统的许多蛋白质仍由细胞核基因组编码,受细胞核调控
因此线粒体和叶绿体是半自主细胞器
9.4. 核糖体-合成蛋白质的“机器”
细胞质中无膜包被的颗粒状结构
- 游离核糖体:悬浮于细胞质内,合成大部分细胞质内蛋白质
- 结合核糖体:结合于粗面内质网外侧,合成膜蛋白与分泌蛋白
- 多聚核糖体:几个核糖体结合于一条 mRNA 链上,增加每分钟的多肽合成
9.5. 细胞内蛋白质分选
- 门控运输: 需要核定位/输出信号
- 跨膜运输: 需要信号肽
- 囊泡运输
核孔是蛋白质出入细胞核的门户
- 蛋白质进入细胞核需要携带富含碱性氨基酸的核定位信号(NLS)
- 蛋白质输出细胞核需要携带富含亮氨酸的核输出信号(NES)。
9.5.1. 蛋白质进入线粒体
蛋白质首先利用线粒体信号序列易位进入线粒体基质;蛋白质要进入线粒体其他位置需要第二段信号肽序列。
9.5.2. 蛋白质进入叶绿体:
先利用叶绿体信号序列进入叶绿体(大地址),切掉后,再利用类囊体信号序列进入类囊体(小地址)。
9.5.3. 蛋白质进入内质网采用共翻译运输
主要是膜蛋白和分泌蛋白
9.6. 内质网的结构与功能:由单层生物膜围成
| 粗糙内质网为扁平囊状,上有许多小颗粒,它们是合成蛋白质的核糖体 | 光滑内质网与糙面内质网相连, 无核糖体附着,为管网状 |
| 与核外膜相连 | 参与固醇激素的合成 |
| 蛋白质合成、修饰和分泌的场所 | 参与脂类和糖类代谢 |
| 与膜蛋白质及分泌性蛋白质的合 成与加工有关 | Ca2+贮存和代谢 动物肝脏细胞的解毒作用 |
9.7. 膜流—以高尔基体为中转站
9.7.1. 高尔基体的结构与功能
由单层生物膜围成的扁平囊体和小泡,“分拣中转站”
- 蛋白质修饰(糖基化等)与加工
- 蛋白质分类、包装、运输及分泌
- 脂质运输
- 多糖合成:在植物细胞分裂时与细胞板和新细胞壁的形成有关
9.8. 膜流—以有被囊泡的形式进行运输
9.9. 溶酶体的结构与功能
- 单层膜球状结构
- 膜内溶液 pH 约 5.0(细胞质 基质 pH 为 7.0)
- 含有多种水解酶和蛋白酶
- 营养物质消化
- 清除衰老和多余细胞器
- 防御功能
9.10. 植物液泡的结构和功能
- 液泡主要出现在植物细胞
- 为单层膜围绕而成的球状结构
- 植物的溶酶体,含水解酶
- 细胞生长发育过程中来自内质网的小液泡,结合成中央液泡,可占据细胞 50%-90%的空间
- 液泡内含有代谢产物如糖,氨基酸,色素,离子以及有毒化合物(贮藏库和垃圾场)
- 液泡对维持细胞形状,增加细胞体积与表面积(利于物质吸收),调节渗透压有重要作用
9.11. 细胞骨架
- 微管(钢筋)
- 微丝(皮筋)
- 中间纤维(绳索)
9.11.1. 细胞内微管的分布与功能
- 支架作用(细胞形态)
- 纤毛或鞭毛摆动
- 细胞分裂(牵拉染色体)
- 细胞内运输(轨道)
- 指导细胞壁的合成方向
9.11.2. 中心体的结构和功能
- 分布:动物细胞内和低等的植物细胞中心
- 结构:中心体(由两个垂直排列的中心粒组成)
- 功能:与细胞有丝分裂有关,形成纺锤体。
9.11.3. 微丝的组成
- 微丝由肌动蛋白单体组成, 呈螺旋状,有极性
- 肌动蛋白单体有 ATP 或 ADP 结合位点
9.11.4. 微丝的分布与功能
- 微绒毛
- 细胞运动(伪足)
- 肌肉收缩
- 细胞质运动(胞质环流)
- 胞质分裂
9.11.5. 中间纤维
参与细胞之间的连接
9.12. 真核生物为什么会有细胞核?
环状 DNA→线状 DNA
9.12.1. 缺点
- 需要确保 DNA 均匀分配 给子代细胞
- 需要防止 DNA 末端粘连
- 需要解决 DNA 复制过程 中的末端缩隐问题
9.12.2. 解决方案
- 着丝粒和纺锤体
- 端粒 p 端粒和端粒酶
9.12.3. 细胞核的结构与功能
- 核膜:核质之间的物质交换与信息交流
- 核质
- 染色质(染色体):DNA(遗传信息的载体)、蛋白质
- 核仁:1)合成 rRNA 和加工 2)核糖体亚基的组装
9.12.4. 核仁的结构与功能
- 纤维中心(FC): rDNA 的存在部位
- 致密纤维组分(DFC): rRNA 的转录加工
- 颗粒组分(GC): 核糖体亚单位成熟、储存和装配
9.13. 细胞分裂
二分裂; 有丝分裂(Mitosis); 减数分裂(Meiosis)
中心体的复制:S期不仅复制 DNA,还复制中心体
双极纺锤体可以自组装
纺锤体位置决定了胞质分裂平面
9.13.1. 细胞什么时候应该分裂
细胞从一次分裂到下一次分裂的阶段称为细胞周期。
- 单细胞生物中细胞周期主要取决于营养状况。
- 多细胞生物:生长因子. 多细胞生物细胞周期的长短取决于 G1 期
G1-S 期是非常重要的检查点:一旦进入 S 期就不能回头了!必须走下去!
9.14. 细胞连接
- 封闭连接:紧密连接
- 锚定连接:桥粒、半桥粒等
- 通讯连接:间隙连接、化学突触、胞间连丝
第二信使是胞内信号分子,负责细胞内的信号转导。当细胞表面受体接受细胞外信号分子后,通过受体及关联分子的作用转导成细胞内信号分子. 主要包括: 环腺苷磷酸(cAMP); 环鸟苷磷酸(cGMP) ; 1,4,5-三磷酸肌醇(IP3)与二酰基甘油; 钙离子
9.15. 细胞分化 (Cell differentiation) :
个体发育中,由一种相同的细胞类型经细胞分裂后逐渐在形态、结构和功能上形成稳定性差异,产生不同的细胞类群的过程。成人人体有 200 多种细胞类型
9.15.1. 形成不同子细胞的方式
- 不对称分裂:子细胞生而不同
- 对称分裂:姐妹细胞由于产生后受外界的影响不同形成不同细胞
9.15.2. 细胞分化机制—基因差异表达
- 每个细胞均含有一套完整的遗传信息
- 每种特定类型细胞只有一部分特定基因表达 (mRNA)
- 细胞分化和发育是基因选择性表达的结果
9.15.3. 基因组中可表达基因分成两类
- 持家基因(housekeeping genes):维持细胞生存所必需的、在各种细胞中都表达的基因
- 组织特异性基因(tissue-specific gene):不同细胞中专一性表达的基因
9.15.4. 细胞分化的同时丧失全能性
- 细胞分化是一个渐进的过程;
- 胚胎发育可以看作是一团细胞的逐级区域化的过程;
- 同时也是逐步丧失发育潜能的过程。
9.16. 细胞衰老是个体衰老的基础
细胞的一生: 分裂 分化 衰老 死亡
9.16.1. 细胞衰老的主要特征:
- 细胞内水分减少,新陈代谢减慢(皱纹)
- 有些酶活性降低(头发变白)
- 细胞内色素逐渐积累,信息传递受阻(老年斑)
- 细胞呼吸减慢,核增大,染色质收缩,染色加深
- 细胞膜通透性改变,运输功能降低